截至2013年12月，徐州医学院拥有国家级重点学科建设培育点1个；省级重点学科6个，省优势学科群1个，“十二五”高校重点专业4个，省级医学重点学科和重点临床专科19个，江苏省优秀学科梯队1个，获中央财政支持地方高校发展专项资金建设项目23项。拥有2个博士学位授权一级学科，硕士学位授权一级学科和临床医学专业学位授权点，具有硕士研究生推免权，并设有2个博士后科研工作站。